秦岭输水隧洞是引汉济渭工程的关键控制性工程，亦是人类从底部横穿秦岭的首次尝试。隧洞全长98.3千米，最大埋深2012米，设计流量70立方米每秒，纵坡1/2500。秦岭输水隧洞穿越地区地质条件极其复杂，常年温度超过40℃，相对湿度高达90%，各类地质灾害综合叠加发生，众多院士、专家评价为“综合施工难度世界罕见”。
受地质地形等条件限制，秦岭输水隧洞采取钻爆法和隧道硬岩掘进机（TBM）联合施工，其中钻爆法施工63.3千米，TBM施工35千米。尤其是TBM施工段，先后遭遇强岩爆、超强岩爆、断层塌方、突涌水、高温高湿、有害气体等地质灾害。据统计，累计发生岩爆4000余次，其中中等等级以上3000余次，最大震级1.6级。陕西省引汉济渭公司联合国内高校科研院所，开展相应技术研究和应用，确保秦岭输水隧洞施工未发生一起较大及以上安全事故的成果。“引汉济渭隧洞施工岩爆预警与防治”成果获得中国岩土力学与工程学会科学技术奖（科学技术进步奖）一等奖。
针对秦岭输水隧洞超长施工通风难题，引汉济渭创立了完整的超长隧洞TBM法和钻爆法新的施工通风成套技术体系，创造了钻爆法无轨运输施工通风距离7.2千米、TBM法独头掘进施工通风距离16.5千米的世界纪录。
